Le service d’inspection de la santé animale et végétale (APHIS) du ministère américain de l’agriculture (USDA) a découvert que le SARS-CoV-2, le virus responsable du COVID-19, s’est largement répandu au sein de la population américaine de cerfs de Virginie, qu’il a pu être transmis de l’homme au cerf, où il a muté et s’est éventuellement retransmis à l’homme. Ces résultats font partie d’une étude portant sur la surveillance de plus de 11 000 cerfs de Virginie.
La recherche APHIS de l’USDA indique que le SARS-CoV-2 s’est largement répandu parmi les cerfs de Virginie des États-Unis, peut-être transmis par l’homme, où il a muté et pourrait s’être transmis à nouveau à l’homme.
Le service d’inspection sanitaire des animaux et des plantes (APHIS) du ministère américain de l’agriculture (USDA) a publié les résultats de sa première année d’études et d’échantillonnage des cerfs de Virginie (Odocoileus virginianus) en vue de détecter une infection active par le SARS-CoV-2, le virus responsable de la maladie COVID-19. Ces études montrent que le SARS-CoV-2 est susceptible de s’être largement répandu au sein de la population américaine de cerfs de Virginie.
En outre, leurs recherches montrent que le SARS-CoV-2 a été transmis de l’homme au cerf, qu’il a muté et qu’il a pu être retransmis à l’homme. Ces recherches nous aident à comprendre si les cervidés, tels que le cerf de Virginie, jouent le rôle d’hôte ou d' »espèce réservoir », c’est-à-dire d’hôte animal où le virus peut survivre et potentiellement évoluer.
Bien que les experts continuent d’en apprendre davantage sur le SRAS-CoV-2 chez les animaux, rien ne prouve que les animaux jouent un rôle important dans la propagation du virus à l’homme.
« Le travail de l’APHIS pour répondre aux questions essentielles de santé publique et animale concernant le SRAS-CoV-2 se poursuit avec cette recherche », a déclaré le Dr Mike Watson, administrateur intérimaire de l’APHIS. « Cependant, des recherches supplémentaires utilisant une approche One Health sont nécessaires pour comprendre quels sont les risques pour la conservation de la faune sauvage et la santé publique avec la circulation continue de cette maladie dans la faune sauvage ».
M. Gary Nohrenberg, directeur des services de la faune sauvage de l’État du Minnesota, parle de la première année de données de surveillance du cerf de Virginie. Cette recherche s’inscrit dans la continuité des travaux de l’APHIS sur le SRAS-CoV-2 dans la faune sauvage et aide l’Agence à mieux comprendre comment une maladie qui affecte à la fois les humains et les animaux se déplace et évolue dans la faune sauvage et comment la recherche nous permet de mieux nous équiper pour faire face à de futures épidémies de maladies zoologiques.
L’APHIS en est actuellement à la deuxième année de cette recherche et a étendu la surveillance du SRAS-CoV-2 à d’autres membres de la famille des cervidés ainsi qu’à d’autres États, territoires et tribus. Au cours de la première année d’échantillonnage, APHIS et ses partenaires ont prélevé plus de 11 000 cerfs de Virginie pour détecter le SRAS-CoV-2. Nous avons détecté le virus chez 12,2 % des cerfs de Virginie et 31,6 % d’entre eux présentaient des anticorps indiquant une exposition antérieure au SRAS-CoV-2. Les données de surveillance de l’année 1, les questions et réponses et d’autres informations sur le programme de surveillance du cerf de Virginie de l’APHIS sont disponibles sur le site web de l’Agence.
La collaboration entre l’APHIS, les agences nationales de protection de la faune sauvage et d’autres organismes pour la surveillance de la faune sauvage pour le SRAS-CoV-2 fait partie d’un effort plus important visant à renforcer la capacité de notre pays à détecter et à répondre aux futures maladies émergentes chez les animaux.
L’APHIS s’est associé à l’Université du Missouri et aux Centres de contrôle et de prévention des maladies (CDC) pour une étude récemment publiée résultant de cette surveillance, « Transmission of SARS-CoV-2 in free-ranging white-tailed deer in the United States » (Transmission du SRAS-CoV-2 chez les cerfs de Virginie en liberté aux États-Unis).
Entre novembre 2021 et avril 2022, l’APHIS, les agences de protection de la faune sauvage des États et des tribus, l’Université de l’État de l’Ohio et l’Université du Missouri ont mené une surveillance de la faune sauvage pour le SRAS-CoV-2 chez les cerfs de Virginie en liberté, en recueillant plus de 9 000 échantillons respiratoires dans 27 États. Nous avons constaté que le SARS-CoV-2 a été transmis de l’homme au cerf de Virginie au moins 106 fois aux États-Unis, qu’il a muté et que, dans trois cas, il a pu être retransmis à l’homme.
« Les cerfs interagissent régulièrement avec les humains et se trouvent couramment dans leur environnement – près de nos maisons, de nos animaux domestiques, de nos eaux usées et de nos déchets », a déclaré le Dr Xiu-Feng « Henry » Wan, professeur à l’université du Missouri et directeur du NextGen Center for Influenza and Emerging Infectious Diseases (Centre NextGen pour la grippe et les maladies infectieuses émergentes). « Le potentiel de persistance et d’évolution du SRAS-CoV-2, ou de toute autre maladie zoonotique, dans les populations d’animaux sauvages peut présenter des risques uniques pour la santé publique ».
L’APHIS mène actuellement de nombreux projets pour comprendre comment le virus du SRAS-CoV-2 se comporte chez différents animaux, comment il se déplace entre les animaux et les humains, et ce que ses partenaires de santé publique peuvent faire pour interrompre la chaîne de transmission. Le cadre stratégique de l’APHIS décrit comment l’agence concentre ses efforts pour prévenir, détecter, enquêter et répondre au SRAS-CoV-2 chez les animaux et à d’autres maladies émergentes qui pourraient menacer les humains et les animaux.
« Cette recherche nous aide à mieux comprendre comment une maladie qui peut affecter à la fois les hommes et les animaux se propage et évolue dans le monde réel, et à mieux nous équiper pour faire face à de futures épidémies de maladies infectieuses », a déclaré le Dr Ria Ghai, chercheur au CDC.
Les groupes de santé humaine, animale et environnementale collaborent de plus en plus lorsque des questions relatives à l’initiative « Une seule santé » se posent. L’APHIS et ses partenaires One Health travaillent ensemble pour exploiter les compétences, les connaissances, les perspectives spécifiques et les expériences uniques afin de renforcer sa compréhension du SRAS-CoV-2 et d’améliorer sa capacité à détecter les maladies plus rapidement.
Référence : « Transmission du SRAS-CoV-2 chez les cerfs de Virginie en liberté aux États-Unis » par Aijing Feng, Sarah Bevins, Jeff Chandler, Thomas J. DeLiberto, Ria Ghai, Kristina Lantz, Julianna Lenoch, Adam Retchless, Susan Shriner, Cynthia Y. Tang, Suxiang Sue Tong, Mia Torchetti, Anna Uehara et Xiu-Feng Wan, 10 juillet 2023, Nature Communications.
DOI: 10.1038/s41467-023-39782-x